Glavna razlika između graha i mahuna je sorta kojoj pripadaju, pa tako grah pripada sorti Phaseolus, dok mahune pripadaju obitelji Fabaceae. Grah po njegovoj botaničkoj pripadnosti svrstava se zajedno s drugim vrstama roda Phaseolus, kao članovima mahunarki porodice Fabaceae.
Razlika između graha i mahuna je u obliku. Grah raste obično u obliku bubrega, a mahune mogu biti plosnate, uže i šire, valjkaste, srpaste, te po dužini kratke i duge.
Također, razlika između graha i mahuna je u boji. Mahune mogu biti tamnije i svijetlije zelene boje, zelene sa ljubičastim mrljama, svijetložute i slično.