Tajno vjenčanje, dvoje djece i 'žena iz snova'
U srpnju 2007., Jason i Lisa dobili su svoje prvo dijete, kći Lolu, a u prosincu 2008. sina Nakoa-Wolfa.
Lisa je također mama 33-godišnje Zoë Kravitz koju je dobila s bivšim suprugom Lennyjem Kravitzom, a koja ima sjajan odnos sa svojim očuhom. Osim toga, i Lenny i Jason su također dobri prijatelji.
Iako se u početku vjerovalo da su se Momoa i Bonet vjenčali još u studenom 2007., oni se nisu previše opterećivali brakom te su tek u listopadu 2017. rekli 'da', i to na tajnom vjenčanju.
Od samog početka, glumac je uvijek otvoreno govorio o svojim osjećajima prema Lisi. U intervjuu iz 2013., rekao je da je vrlo sretan čovjek jer je s njom, a 2016. je dodao: "Ona je moja žena iz snova", i usporedio je s anđelom.
Nekoliko godina kasnije, Momoa je za Esquire u studenom 2019. rekao da je vjenčanje s Lisom za njega bio jedan od većih uspjeha u životu. "Ako netko kaže da nešto nije moguće, ja mu kažem: 'Slušaj, oženio sam Lisu Bonet. Sve je je***no moguće'", rekao je Momoa tada.